Кафедра госпитальной хирургии в Омском медицинском институте была организована в 1922 году и первоначально располагалась на базе военного гарнизонного госпиталя. Кафедрой руководил профессор Борман Владимир Леонидович.
С 1933 года кафедра размещается на базе больницы Омской железной дороги и находилась там до 1 сентября 1963 года, то есть в течение 30 лет.
Профессор Алексей Алексеевич Ожерельев заведовал кафедрой госпитальной хирургии с 1933 по 1937 гг. По инициативе и при активном участии профессора Ожерельева А.А. на базе железнодорожной больницы была организована станция переливания крови, которая функционирует до настоящего времени. По его инициативе в Омске открыт городской онкологической диспансер.
В 1936 году на кафедру госпитальной хирургии в железнодорожную больницу переведен курс военно-полевой хирургии с доцентом Александром Петровичем Поповым. Сотрудниками кафедры приходилось постоянно иметь дело с тяжелой железнодорожной травмой, что в определенной степени и определило направление ее работы.
С 1 сентября 1939 года по 10 августа 1940 года кафедрой заведовал профессор Иост Владимир Иванович.
С 1 сентября 1940 по 22 июня 1941 года кафедрой заведовал Попов Александр Петрович. Им выполнено около 40 научных работ, основные из которых посвящены вопросам хирургии грыжи, пептических язв тонкой кишки, пересадке мочеточников в прямую кишку и др.
С 1941 по 1951 г. кафедру возглавлял профессор Анчелевич Вениамин Давыдович. В годы Великой Отечественной войны и в послевоенном периоде профессор Вениамин Давыдович особое внимание уделяет травме (военной и мирной), изучая, преимущественно повреждения на железнодорожном транспорте, где расположена кафедра госпитальной хирургии.
С 21 декабря 1951 года по 25 августа 1952 год кафедрой заведовала профессор Окулова Антонина Николаевна. В 1946 г. в клинике госпитальной хирургии впервые в г. Омске применили современный интратрахеальный наркоз (используя американский аппарат).
С 1 июля 1952 года по сентябрь 1953 года кафедру возглавляла профессор Герасимова Антонина Васильевна. Сотрудники кафедры госпитальной хирургии были вовлечены ею в тематику научных работ по торакальной хирургии.
С 1953 по 1956 гг. доцент Шкляев Валерий Васильевич исполнял обязанности заведующего кафедрой госпитальной хирургии. Это был опытный хирург, прошедший школу Великой Отечественной войны. Профессор Шушков Геннадий Дмитриевич возглавлял кафедру госпитальной хирургии с курсом военно-полевой хирургии и травматологии с 1956 по 1962 гг. Геннадий Дмитриевич – хороший хирург и диагност с большой теоретической подготовкой и практическим опытом, владеющим хирургической техникой сложных операций, хороший организатор и педагог. Лекции его отличались глубиной изложения предмета и методичностью. В 1956–1957 гг. по инициативе профессора Шушкова Г.Д. при кафедре организован и оснащен виварий и экспериментальный блок, в котором проводились опыты по изучению биологии костно-мышечно-костных круглых стеблей. В этот период кафедра разрабатывала вопросы патогенеза и лечения шока. Клиникой был освоен метод гипотермии, широко применялся эндотрахеальный наркоз, что позволяло успешно выполнить наиболее тяжелые и сложные операции на органах брюшной и грудной полостей.
С 16 февраля 1962 по 1985 гг. кафедру возглавлял профессор Макоха Николай Сафронович, который являлся пионером в вопросах хирургии панкреатодуоденального рака в Сибири и Дальнем Востоке. Коллектив кафедры им возглавляемый целенаправленно работал в области хирургической патологии печени, желчных путей и поджелудочной железы. Разработаны диагностические тесты отдельных локализаций рака панкреатодуоденальной зоны и внепеченочных желчных путей, четко сформулированы показания к выбору методик хирургического вмешательства.
В течение 12 лет он являлся главным хирургом города Омска. Его отличали трудолюбие, высокая требовательность к себе и сотрудникам, гуманизм, принципиальность. Им выполнено более 100 печатных работ, которые известны широкому кругу ученых нашей страны и за рубежом. Под его руководством выполнено 2 докторские и 18 кандидатских диссертаций. С 1965 года по инициативе кафедры впервые в Омском мединституте введен курс преподавания онкологии на базе типового городского онкологического диспансера и организовано научное медицинское общество онкологов.
В 1963 году кафедра была переведена из железнодорожной больницы в МСЧ № 2, а в 1980 году вновь возращена обратно в железнодорожную больницу после введения в строй нового корпуса.
Профессор Павлов Виктор Васильевич возглавлял кафедру госпитальной хирургии ОМИ с 1985 по 1996 гг. Профессор В.В. Павлов является автором 182 научных публикаций по различным разделам хирургии, в том числе 2-х монографий и одного учебно-методического руководства. По изобретательской работе имеет 9 авторских свидетельств, ряда методических рекомендаций по различным разделам хирургии. В течение 5 лет был главным хирургом г. Омска. Под руководством профессора В.В. Павлова успешно защищены 6 кандидатских и 1 докторская диссертации.
В 1991 году кафедра госпитальной хирургии переведена на новую базу – больницу скорой и неотложной помощи, расположенную на Левобережье г. Омска. Штат преподавателей кафедры в период заведования профессором В.В. Павловым был следующий: профессор Яжик С.И., доцент Ю.А. Зыков, ассистенты С.А. Никитченко, Г.И. Селезнев, В.М. Куламихин, В.А. Буданов, Косенок В.К. (в настоящее время является заведующим кафедрой онкологии в Областном онкодиспансере с 2003 года).
С 2000 г. кафедра госпитальной хирургии переименована в курс хирургических болезней при кафедре общей хирургии (зав. проф. К.К. Козлов), а в 2001 году реорганизована в кафедру хирургических болезней № 2. С 2005 года к кафедре вернулось ее прежнее название – кафедра госпитальной хирургии.
Филиппов Сергей Иванович доктор медицинских наук, профессор, заведовал кафедрой госпитальной хирургии с 2001 по 2012 год.
В практику хирургических отделений при его помощи внедрены новые методы экстракорпоральной гемокоррекции: гемосорбция, ксеногемо-перфузия, плазмаферез, криогепариновая преципитация, плазмосорбция, ЭУФО и ВЛО крови.
С 2012 года кафедрой заведует доктор медицинских наук Деговцов Евгений Николаевич. В настоящее время научными направлениями кафедры являются: профилактика и лечение гнойно-септической инфекции с использованием новых технических средств и физических факторов, а также использование минимально инвазивных технологий в диагностике и при лечении острой хирургической патологии, желчнокаменной болезни и ее осложнений, разработка современных методов лечения грыж живота, внедрение современных методов бариартрической хирургии при морбидном ожирении.
24.11.19 состоялась научно-образовательная конференция "Современные подходы к диагностике и лечению хирургических заболеваний" посвященная памяти профессора Николая Сафроновича Макоха, на которой было принято решение ходатайствовать перед ректором ОмГМУ о присвоении кафедре госпитальной хирургии имени Н.С. Макохи. Приказом ректора ОмГМУ М.А. Ливзан с 01.12.2019 кафедра госпитальной хирургии ОмГМУ носит имя проф. Н.С. Макохи.
Коллектив кафедры госпитальной хирургии. 2014 год.
Нижний ряд: асс. С.С. Павлов, проф. И.И. Котов, зав. кафедрой Е.Н. Деговцов, доцент К.А. Низовой, доц. В.А. Клинков.
Верхний ряд: асс. О.А. Бублейник, асс. С.И. Бархатов, асс. Д.А. Калиниченко, врач ст.-лаб. В.А. Варкентин, преп. М.С. Афонина
В настоящее время штат сотрудников кафедры состоит из: зав. кафедрой Е.Н. Деговцов, проф. И.И. Котов, доцент Д.А. Калиниченко, доцент В.А. Клинков, асс. С.С. Павлов. Также в работе кафедры принимают участие внештатные совместители:проф. Филиппов С.И., д.м.н. А.Р. Пропп, д.м.н. В.И. Широкорад, д.м.н. Д.В. Сидоров, асс. О.А. Бублейник, асс. А.А. Кинзерский, асс. Т.С. Дергачева.