Кафедра детских инфекционных болезней была организована в августе 1948 года на базе городской детской инфекционной больницы № 1 (ул. Гусарова, 29). Клиническая инфекционная больница № 1 (корпус 1), 50-е годы XX века. Мощность первой клинической базы – 200 коек: 4 отделения для воздушно-капельных инфекций (дифтерия, скарлатина, корь, краснуха, ветрянка, коклюш, паротит и др.). На территории больницы располагались три больничных барачных корпуса, физиотерапевтическое отделение, операционная, рентгенкабинет, клинико-бактериологическая лаборатория. Кроме того, для учебных целей использовались детские инфекционные отделения в МСЧ № 7, ДКБ № 8.
Инфекционный стационар БУЗОО "ГДКБ №3", 2011 г.
В настоящее время клиническая база кафедры – 300 коек расположена в двух инфекционных стационарах БУЗОО "Городская детская клиническая больница №3" и БУЗОО "Омская городская клиническая больница №1 им. А.Н. Кабанова" г. Омска, где имеется 8 инфекционных отделений (по 4 на каждой базе). Кроме этих отделений, в каждом стационаре имеются отделения интенсивной терапии и реанимации, клинико-биохимические и бактериологические лаборатории.
Первым заведующим кафедрой детских инфекционных болезней в ОГМИ была доцент, затем профессор, доктор медицинских наук Галина Алексеевна Сиземова (1908-1995). Профессор Г.А. Сиземова – выпускница ОГМИ им. М. И. Калинина 1930 года. Прошла хорошую школу детского врача в практическом здравоохранении Кузбасса и Омской области, в течение шести лет работала врачом-интерном в инфекционной больнице в г. Омске, закончила клиническую ординатуру при кафедре инфекционных болезней, защитила кандидатскую диссертацию по туляремии в Ханты-Мансийском национальном округе в 1943 году. С первых дней Великой Отечественной войны Г. А. Сиземова была военврачом 3 ранга в ППГ 463 и 467, но в 1942 году была комиссована в тыл по состоянию здоровья и принята на должность ассистента кафедры инфекционных болезней, после защиты кандидатской диссертации была избрана доцентом этой кафедры. Научным руководителем ее была профессор Л. А. Розеньер. Г. А. Сиземова является первооткрывателем Омской геморрагической лихорадки (ОГЛ). Прекрасный врач и педагог, интеллигентная, доброжелательная, внешне обаятельная. В лекциях для студентов и врачей она передавала свой богатый опыт, свое видение того или иного вопроса, при их чтении уходила от обычного академизма. На ее врачебных обходах, научно-практических конференциях всегда ощущалась широта врачебного кругозора, большая склонность к анализу фактов, выявлению ошибок диагностики и лечения. В 1963 году Галина Алексеевна успешно защитила докторскую диссертацию «Клинико-эпидемиологическая характеристика ОГЛ» в АМН СССР. Научными консультантами у нее были заслуженный деятель науки РСФСР профессор Р. М. Ахрем-Ахремович и академик АМН СССР, профессор М. П. Чумаков. Заведовала кафедрой детский болезней в ОГМИ Г. А. Сиземова в течение 24-х лет, до 1972 года. Затем еще два года работала в должности профессора кафедры. Под руководством Г. А. Сиземовой выполнены докторская диссертация В. Н. Дроздова и шесть кандидатских диссертаций (Е. Е. Шестакова, В. Н. Дроздов, К. П. Мясникова, В. А. Макаров, Н. Н. Афанасьев, В. И. Мордовец). Ею были написана монография по ОГЛ, к сожалению, не опубликованная. Она соавтор монографий по дифтерии (Кемерово, 1971), ошибкам диагностики инфекционных болезней (Томск, 1976). Под ее редакцией выпущено 5 сборников НИР кафедры. Автор 108 научных работ, в том числе 6 методических пособий для врачей и учебно-методических рекомендаций для студентов.Г. А. Сиземова была членом проблемных комиссий МЗ СССР и Омского Облздрава, награждена орденом «Знак почета», медалями «За победу над Германией» в 1941-1945 гг., «За доблестный труд к 100-летию В. И. Ленина», значком «Отличник здравоохранения СССР», почетными грамотами МЗ СССР и РСФСР. В 1975 году вышла на заслуженный отдых, переехала в Ленинград, где прожила 20 лет. Умерла на 88-ом году жизни. Похоронена на Волковском кладбище.
Вторым заведующим кафедрой после Г. А. Сиземовой была доктор медицинских наук, профессор Роза Ивановна Рудакова (1927-1994). Роза Ивановна также выпускница ОГМИ 1950 года. В течение 12 лет работала врачом инфекционистом в Кузбассе (г. Новокузнецк), затем обучалась в клинической ординатуре на кафедре инфекционных болезней ОГМА. В 1965 году защитила кандидатскую диссертацию по клинике и лечению сальмонеллезов, затем продолжила эту тему и в 1972 году защитила докторскую диссертацию под руководством заслуженного деятеля науки РСФСР, заведующего кафедрой инфекционных болезней Свердловского медицинского института, профессора А. И. Кортева. Совместно с ним издала монографию «Сальмонеллез в Западной Сибири». Р. И. Рудакова руководила кафедрой в течение 22-х лет (1972-1994 гг.). Большое внимание уделяла развитию материально-технической базы кафедры, учебному процессу, методической работе. Под ее руководством выполнено 5 кандидатских диссертаций (Л. Н. Пайманова, Ф. В. Носкова, Н. А. Бударина, В. В. Фоменко, Н. А. Бачерикова), выпущено 3 учебно-методических пособия по программированному обучению, дифтерии и «ВИЧ-инфекции у детей». Она принимала участие в «Методических разработках по преподаванию детских инфекционных болезней у детей в субординатуре», которые изданы в двух томах (издат ФАН УССР, Ташкент, 1981). Р. И. Рудакова опубликовала 166 научных работ, вела большую методическую работу по НОУП в институте. Постоянно оказывала помощь практическому здравоохранению, являясь главным детским инфекционистом Облздравотдела, избиралась заместителем председателя и председателем секции детских инфекционистов Омского отдела Всесоюзного и Всероссийского обществ инфекционистов. Неоднократно награждалась грамотами МЗ СССР и РСФСР. Отличник здравоохранения СССР. Умерла Роза Ивановна Рудакова в 1994 возрасте 67 лет. Похоронена на Южном кладбище в Омске.
Третий заведующий кафедрой – доктор медицинских наук, профессор, заслуженный деятель науки РСФСР Виктор Николаевич Дроздов, выпускник ОГМИ 1959 года, заведовал кафедрой с 1994 по 2004 год. После окончания ОГМИ с отличием В. Н. Дроздов обучался в клинической ординатуре по детским инфекциям в ОГМИ, затем в течение 10 лет работал ассистентом и доцентом этой кафедры. В 1964 году защитил кандидатскую, а в 1968 году – докторскую диссертацию по эпидемиологии, клинике, лечению и профилактике описторхоза у детей. Его научными руководителями были профессор Г. А. Сиземова и А. П. Скабичевский, биолог. После защиты докторской диссертации В. Н. Дроздов работал в течение 25 лет в Кемеровском и Кировском медицинских институтах, организовал там 2 кафедры: детских инфекционных болезней в Кемерово и инфекционных болезней с детскими инфекциями и эпидемиологией – в Кирове, долгое время был проректором по науке в Кемерово. Но, находясь вне стен alma mater, он постоянно поддерживал связь с нею. В 1994 году вернулся в Омск: в течение первого пятилетия заведовал объединенной кафедрой инфекционных и детских инфекционных болезней, а с 1999 г. заведовал кафедрой детских инфекционных болезней. В. Н. Дроздов – автор более 900 научных работ, среди которых 18 монографий, изданных в центральных и местных издательствах, имеет 2 изобретения, 44 рационализаторских предложения, 12 учебных пособий, в том числе 4 с грифом УМО, методических рекомендаций, изданных по решению МЗ СССР и РСФСР, областных отделов здравоохранения. Тематика их касается проблем описторхоза, дифтерии, смешанных инфекций, ошибок диагностики и лечения эпидемического паротита, рожи, псевдотуберкулеза и иерсиниозов, клещевых нейроинфекций и других. Он соавтор «Руководства по инфекционным заболеваниям у детей» В. Ф. Учайкина, монографий «Очерки инфекционных и схожих с ними заболеваний», «Зоонозы и инфестации человека», «Лекции по экзантематозным инфекциям у детей». В. Н. Дроздов являлся экспертом государственной программы «Здоровье населения России», членом проблемной комиссии по детским инфекциям и учебно-методической комиссии МЗ РФ по инфекционным болезням, главным детским инфекционистом ГУЗО, членом редакционных Советов центральных журналов «Вопросы охраны материнства и детства», «Эпидемиология и инфекционные болезни», «Детские инфекции». Под его редакцией издано 40 сборников НИР, выполнено 3 докторских и 40 кандидатских диссертаций, из них в ОГМА за годы заведования 1 докторская и 12 кандидатских диссертаций. В 2004-2010 гг. В.Н.Дроздов работал профессором кафедры. Умер Виктор Николаевич Дроздов на 80-м году жизни в 2015 году.
С 2004 г. по 2023 г. кафедрой руководил доктор медицинских наук, профессор Юрий Борисович Белан. Его докторская диссертация посвящена проблемам кардиологии в педиатрии. Ю.Б. Белан автор трех монографий, в т.ч. по экзантематозным инфекциям, по фармакотерапии геморрагических лихорадок у детей, нарушениям ритма при дисплазии соединительной ткани. Имеет более 170 научных публикаций, соавтор 33 учебно-методических пособий,14 с грифом УМО. Под его руководством ведутся научные исследования, касающиеся вопросов вирусных инфекций респираторного тракта и оппортунистических инфекций у детей, защищены 9 кандидатских диссертаций. Профессор Белан Ю.Б. является главным экспертом по детским инфекционным болезням МЗ Омской области, председателем омского отделения педиатров-инфекционистов, комиссии по ОВП МЗОО, член редакционного совета журнала "Детские инфекции".