В связи с обновлением государственных образовательных стандартов высшего профессионального образования в 1999–2000 учебном году на кафедре биохимии ОмГМА было организовано проведение занятий на лечебном, педиатрическом и медико-профилактическом факультетах по элективным дисциплинам: клинической биохимии и клинической лабораторной диагностике.
В 2001 году приказом ректора при кафедре биологической химии был создан курс клинической биохимии и лабораторной диагностики, призванный обеспечивать проведение занятий со студентами и курс клинической лабораторной диагностики для последипломного образования врачей. В 2007 году клиническая биохимия и клиническая лабораторная диагностика решением ректората выведены из состава элективов и установлены обязательными учебными дисциплинами в программе подготовки студентов лечебного, педиатрического, медико-профилактического и стоматологического факультетов.
1 сентября 2011 года приказом ректора создана кафедра клинической лабораторной диагностики ОмГМА. Руководит кафедрой д.м.н., доцент Индутный Антон Васильевич, являющийся председателем правления Омской региональной общественной организации «Ассоциация специалистов лабораторной медицины», входящей в состав Российской ассоциации медицинской лабораторной диагностики.
