Приказ о создании музея колледжа был издан 31 августа 1999 года – в канун 75-летия со дня основания училища. Ответственным была назначена Пожерукова Валентина Васильевна - преподаватель колледжа, выпускница медицинского училища 1959 года.
Началась интенсивная работа по сбору материалов, относящихся к истории колледжа. К этой работе привлекались и студенты. Каждый студент, выходящий на учебную и государственную практику в лечебные учреждения, получал индивидуальное задание.
С большой заинтересованностью к созданию музея отнеслись бывшие выпускники Омского военно-медицинского училища им. Н.А. Щорса во главе со своим бывшим командиром Б.Н. Анненковым. Они передали в фонд музея колледжа ценные экспонаты и исторические документы из жизни училища. Это генерал- лейтенант Российской Армии А.В. Коскин, генералы медицинской службы В.П. Спичев, М.И. Бачурин, полковник Ю.А. Власов, полковник медицинской службы В.М. Киляков, подполковники медицинской службы М.Т. Майоров, А.А. Симаков и др.
Пополнились фонды музея и за счет поступлений из государственного архива города Омска, архива военно-медицинского музея города Санкт-Петербурга, из личных архивов сотрудников и выпускников училища.
В конце 2000 года за большую поисково-исследовательскую работу, создание экспозиций, отражающих славу и доблесть России и успехи в патриотическом воспитании молодежи Главным управлением культуры и искусства Администрации Омской области музей зарегистрирован с присвоением звания « Музей истории Республиканского медицинского колледжа № 3».
Сегодня музей является составной частью воспитательной работы колледжа. Одна из его главных задач - сохранение преемственности поколений, воспитание студентов на принципах уважения к традициям учебного заведения, на примерах высокого исполнения профессионального и гражданского долга, милосердия.
Для студентов 1 курса проводятся ознакомительные экскурсии в музее, в ходе которых они получают не только информацию об истории колледжа, но и о его традициях.
Активно посещают музей и школьники города Омска и Омской области в дни открытых дверей. Часто в музее можно встретить бывших выпускников, ветеранов и гостей колледжа.
В традициях колледжа всегда было стремление поддерживать связь со своими выпускниками. И сегодня музей поддерживает связь с Московским Советом ветеранов-выпускников Омского военно-медицинского училища им. Н.А. Щорса, с выпускниками военных лет. Проводятся встречи с родственниками бывших выпускников, сотрудников и преподавателей училища, которые передали в фонд музея ценные исторические документы, письма, фотографии.
Разнообразные формы, используемые для патриотического воспитания молодежи, представлены в музее в виде фильмов, презентаций, методических разработок тематических вечеров и конкурсов, встреч с выпускниками. Накопленный опыт, богатый экспозиционный фонд, широкое использование технических средств и педагогическое мастерство преподавателей колледжа дают возможность воспитывать подрастающее поколение истинными патриотами России.
Музей истории колледжа получил общественное признание. Его деятельность отмечена многочисленными грамотами, дипломами.