Кафедра биохимии была организована в марте 1921 года профессором Андреем Петровичем Корховым. Первоначально кафедра называлась кафедрой физиологической химии и располагалась на территории Ветеринарно-зоотехнического института, а затем переведена в главный корпус Омского медицинского института.
С 1930 по 1941 год кафедрой заведовали проф. Э.Э. Мартинсон, проф. А.Д. Бернштейн, профессор физиологии ветеринарного института Д.Я. Криницин. В эти годы на кафедре начали работать преподаватели: Е.Ф. Васильев (в дальнейшем - доцент кафедры гигиены), А.С. Степаненко (позднее – доцент, заведующая кафедрой), К.Н. Груздева (позднее – доктор наук, заведующая кафедрой).
В военные годы (1941-1945) на базу Омского Медицинского Института был эвакуирован Второй Московский Медицинский институт, и заведование кафедрой было поручено доценту А.П. Бархаш. Направлениями научных и клинико-лабораторных исследований в это время были изучение обмена веществ при различных формах дистрофии, способ получения препаратов, содержащих аскорбиновую кислоту и внедрение их в массовое производство.
Значительные изменения в структуре и учебном процессе произошли в послевоенные годы, когда кафедрой заведовала в течение 20 лет доцент А.С. Степаненко (1945 - 1964 годы). При кафедре биохимии были открыты курсы органической химии (лекции читал доцент М.М. Киреев), физической и коллоидной химии (доцент К.Н. Груздева). Сотрудниками кафедры благодаря использованию сочетания методов радиоизотопных исследований и классической биохимии защищаются кандидатские диссертации Т.П. Сарапкиной, Б.А. Антифьевой, Л.Т. Громовой, В.Г. Ткаченко.
С 1961 года кафедра располагается в санитарно-гигиеническом корпусе.
В 1965 году на кафедре впервые защищена докторская диссертация доцентом К.Н. Груздевой, которая с этого года избрана заведующей кафедрой и получает звание – профессора. С этого периода начинается новый этап в истории кафедры. Профессор К.Н. Груздева формирует постоянный коллектив кафедры в составе доцентов А.С. Степаненко, Б.А. Антифьевой, Т.П. Сарапкиной, ассистентов – кандидатов наук М.П. Березовской, В.Е. Высокогорского, В.К. Леонтьева, Р.Ф. Новиковой, Ю.Ф. Скляренко, В.Г. Ткаченко, Л.А. Судаковой.
При кафедре открывается аспирантура – первые аспиранты кафедры: В.Д. Конвай (в последующем - профессор); Э.А. Раднаев (целевой аспирант из Читы, в дальнейшем – зав. кафедрой химии Читинского мединститута).
Научная лаборатория кафедры оснащается польским оборудованием, спектрофотометрами, хроматографическими коллекторами, рефрижераторной комнатой и рефрижераторными центрифугами. Научные исследования сотрудников кафедры в этот период были посвящены проблемам метаболических нарушений при интоксикациях промышленными ядами. По этой проблеме защитили кандидатские В.Г. Купор, Ю.Ф. Скляренко, С.И. Афонина и другие.
В учебный процесс активно внедряются элементы программированного обучения. Большое внимание уделяется подготовке учебных стендов и эстетическому оформлению кафедры, в результате кафедра биохимии становится одной из лучших кафедр по учебно-методической работе.
С 1975 года на базе кафедры проводятся экспериментальные работы по проблеме «Наркология» совместно с сотрудниками кафедр психиатрии, судебной медицины, биологии.
С 1987 года кафедрой заведует В.Е. Высокогорский, который активно работает над докторской диссертацией и защищает ее в 1992 году. На кафедре продолжаются исследования биохимических аспектов алкогольной интоксикации в сочетании с различными патологическими состояниями. В 1989 году на базе кафедры открывается первый компьютерный класс и в учебный процесс активно внедряются информационные технологии.
В 1999 - 2000 учебном году на кафедре биохимии начато проведение занятий по клинической биохимии и клинической лабораторной диагностике на лечебном, педиатрическом и медико-профилактическом факультетах, что было связано с введением новых государственных образовательных стандартов высшего профессионального образования.
В 2001 году приказом ректора организован курс клинической биохимии и лабораторной диагностики при кафедре биологической химии, который интегрирует вузовское и послевузовское образование по данному разделу медицины.
В 2007 году клиническая биохимия и клиническая лабораторная диагностика выведены из состава элективов и установлены обязательными учебными дисциплинами в программе подготовки студентов лечебного, педиатрического, медико-профилактического, стоматологического факультетов. В связи с этим пересмотрены рабочие программы, в которых расширено рассмотрение вопросов диагностики ургентной патологии с помощью современных технологических средств, актуализированы современные клинико-лабораторные алгоритмы диагностики. Разработаны учебные планы и программы 2-х новых элективных курсов: «Современные технологии определения групповой и резус-принадлежности крови» (16 ч), «Алгоритмы клинико-лабораторной оценки состояния системы гемостаза» (16 ч.), которые начали реализовываться с 2008 – 2009 учебного года для студентов педиатрического и лечебного факультетов. Доцент А.В. Индутный подготовил и издал методические пособия для самостоятельной работы студентов по интерпретации результатов гематологического анализа.
С 2004 года по 2010 год издано 7 учебно–методических пособий, из них 3 издания, рекомендованных УМО по медицинскому и фармацевтическому образованию вузов России.
С 2008 года сотрудники кафедры участвуют в проведении выездной сессии на заочном отделении фармацевтического факультета. В 2008 году учебно–консультативная работа проводилась в городах Нижневартовск, Павлодар, Петропавловск, Кокшетау. Количество обучающихся – 61 человек. В 2009 году дополнительно к перечисленным городам, обучение проводилось в г. Курган. Количество студентов – 117 человек.
С 2008 года кафедра участвует в системе дистанционного обучения студентов заочного отделения фармацевтического факультета. Для обеспечения учебного процесса по данной форме обучения сотрудниками кафедры было составлено электронное пособие по общей биохимии, тестовые задания для самопроверки знаний, экзаменационный тест.
Сотрудники кафедры активно участвуют в проведении научных исследований, направленных на изучение особенностей метаболических нарушений при воздействии алкоголизации и сахарного диабета, пренатальной алкогольной интоксикации с целью выявления взаимовлияния на метаболические процессы этих факторов.
С 2005 года опубликованы статьи в центральных журналах, рекомендованных ВАК Минобрнауки РФ: «Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии», «Биомедицинская химия», «Наркология», «Клиническая лабораторная диагностика», «Морфология», «Сибирский вестник психиатрии и наркологии», «Химико-фармацевтический журнал», «Вопросы питания» и других.
Под руководством профессора В.Е. Высокогорского защитили кандидатские диссертации: Фонякова О.Г. (1995), Рыжковская Э.Ю. (1996), Индутный А.В. (1997), Степанова И.П. (1999), Антонова Е.И. (1999), Самусева Н.Л. (2002), Аксенов А.В. (2004), Притыкина Т.В. (2005), Атавина О.В. (2005), Ефременко Е.С. (2006), Жукова О.Ю. (2008), Лазарева О.Н. (2008), Булгакова В.С. (2008), Ноздрунова А.А. (2009), Плаксина А.Г. (2010), Быков Д.Е. (2010), Веселов П.В. (2010) и 4 докторские диссертации: Степанова И.П. (2004), Струев И.В. (2005), Антонова Е.И. (2009), Индутный А.В. (2010).
Указом Президента Российской Федерации Д.А.Медведева от 4 января 2009 года заведующему кафедрой доктору медицинских наук, профессору В.Е. Высокогорскому присвоено почетное звание «Заслуженный работник высшей школы Российской Федерации».
На курсе клинической лабораторной диагностики действует на постоянной основе система сертификационных циклов и циклов общего усовершенствования, работают циклы тематического усовершенствования по иммуноферментному анализу, иммуногематологии, осуществляется стажировка врачей по соответствующим разделам лабораторной медицины на рабочем месте под руководством преподавателей курса.
На кафедре за период с 2004 по 2008 годы на циклах усовершенствования и переподготовки по клинической лабораторной диагностике прошли обучение на внебюджетной основе более 500 врачей лабораторной службы региона, подготовлены 2 ординатора и 3 интерна. На 2007 год пришелся резкий рост числа желающих обучаться в интернатуре по клинической лабораторной диагностике. Так в 2007 - 2008 учебном году на кафедре прошли обучение уже 5 интернов и 1 ординатор. Вследствие отмены решениями федерального уровня краткосрочных вариантов первичной специализации по клинической лабораторной диагностике уже в 2008 - 2009 учебном году на курс клинической лабораторной диагностики принято рекордное количество интернов - 54 человека.
В связи с включением в учебные программы вопросов лабораторной медицины и клинической биохимии с 2007 года кафедра биологической химии преобразована в кафедру биохимии и лабораторной медицины с курсом клинической лабораторной диагностики последипломного образования. А c 2011 года преподавание клинической лабораторной диагностики осуществляется на самостоятельной кафедре под руководством д.м.н. Индутного А.В.
В сентябре 2011 года кафедра биохимии (зав. проф. д.м.н. Высокогорский В.Е.) совместно с только что организованной кафедрой клинической лабораторной диагностики (зав. доцент д.м.н. Индутный А.В.) принимала участников Всероссийской научно-практической конференции "Медицинская биохимия и клиническая лабораторная диагностика в аспекте модернизации системы научных исследований". Конференция проходила под эгидой Объединения биохимиков Урала, Поволжья и Западной Сибири. Всего приняло участие более трехсот человек из разных городов (Омска, Москвы, Уфы, Челябинска, Перми, Екатеринбурга, Тюмени, Астрахани, Томска, Нижнего-Новгорода, Самары, Казани, Оренбурга).
С 2012 до 2024 года кафедрой заведовал доцент Е.С. Ефременко.
C 2019 кафедра биохимии участвует в проекте "Базовые школы РАН", который реализуется в соответствии с указанием Президента РФ В.В. Путина от 28 декабря 2018 г. (№Пр-2543). В 2022-2023 годах сотрудниками кафедры подготовлено 3 учебных пособия:
1). Чигринский, Е. А. Методы экспериментальной биохимии / Е. А. Чигринский, Е. С. Ефременко. – Омск : ООО «Полиграфист», 2022. – 136 с.
2). Чигринский, Е. А. Биохимия тканей и жидкостей полости рта: Учебное пособие / Е. А. Чигринский, Е. С. Ефременко, П. П. Золин. – Омск : ООО «Полиграфист», 2022. – 83 с.
2). Чигринский, Е. А. Биохимия тканей и жидкостей полости рта: Учебное пособие / Е. А. Чигринский, Е. С. Ефременко, П. П. Золин. – Омск : ООО «Полиграфист», 2022. – 83 с.
3). Рабочая тетрадь по биохимии [Электронный ресурс] : учебное пособие / А. А. Ходосевич, Е. С. Ефременко; Омский государственный медицинский университет. - Электрон. текстовые дан. - Омск : [б. и.], 2023. - 100 с. - Загл. с титул. экрана. - Библиогр.: с. 100. - Б. ц.
С 2024 года кафедрой заведует доктор биологических наук, доцент Корнякова Вера Валерьевна.
